Bohinjsko jezero leži v ledeniško izoblikovani jezerski skledi in premore skoraj 100 milijonov kubičnih metrov vode. Po stari bohinjski šali le za en »škaf«, če je ta zadosti velik. Jezerska kotanja, ki se strmo spušča, je nerazčlenjena in brez plitvin. Pretočno jezero se poleti na površini segreje do 22°C, pozimi pa pogosto tudi zmrzne. Gladina vode se ob močnem deževju zviša za 2 do 3 m. Voda v Bohinjskem jezeru se obnovi trikrat letno. Glavni dotok je Savica, glavni odtok pa Sava Bohinjka.